如何对GEO数据库中已有的数据进行分析

差异表达基因的筛选(阀值)以及后面的生物信息分析都可以做的.差异表达基因筛选步骤:选择geo数据——下载芯片数据——差异分析(方法有很多:sam法,r包处理,t-test检验等)——选择想要的阈值(fold change >4)

如何分析GEO数据库中某一疾病的差异基因

除了文献以外,也可以考虑OMIM数据库omim这个数据库的宗旨就是收集疾病及其相关基因的信息的.不过可能存在的问题就是对于疾病的划分比较系统详尽,不是说输入个糖尿病就直接出来一个列表,它对疾病进行了更进一步的分类,需要你仔细看一看,而且对于疾病的描述是很详尽的,不只是简单一个列表,需要你仔细读完,然后才能了解到底有什么相关基因.不过好处就是相当于简化了你找综述得步骤,而且相对比较全面.

GEO数据分析出现问题,求教

具体问题具体分析,GEO数据整理,是不是发现不是gene symbol,而是其他ID

如何在NCBI里得到序列

你这个是编号要zd在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863

基因工程为什么要测定全部碱基序列,而不是基因的碱基序列

因染色体结构上的缺失而导致碱基序列发生改变只是打乱了原有基因上碱基序列的排列方式,并没有新生成什么东西~

如何用uniprot数据库将蛋白名字转换成基因名字

你说呢.

为什么基因存在不连续序列而不是连续的

DNA中的不连续基因又称断裂基因,为真核生物所特有.DNA中一个基因中有的序列为编码蛋白质的序列,有的不编码蛋白质,这些序列相间排列构成断裂基因编码的序.

为什么第一个空填的是基因序列而不是脱氧核苷酸序列?

因为脱氧核苷酸序列里包含显性密码子和隐性密码子,而能决定和被翻译出来蛋白质的是显性密码子,也就是基因

NCBI中查找的基因序列名称中的含义是什么?

我只知道第一个问题哈sp.是species的缩写,也就是一种,而spp.代表一个类群,比如一个属的一群微生物

ncbi数据库怎么查找基因序列

在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序.