什么叫模式菌株
模式菌株（type strains）又称标准菌株，通常需要由至少两个不同国家的专门保藏机构保藏的菌株，一个菌株在同一个保藏机构有且仅有永久保藏号。看一个保藏菌株是否是标准菌株的标志是在菌株名后有一个上标的T (Type)；每种菌可以有多个标准菌株。
微生物的命名原则和方法
所有正式分类单元（包或亚种和亚种以上等级的分类单元）的学名，必须用拉丁词或者其他词源经拉丁化的词命名。
（1）属名
属名用一个单数主格名词或当做名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。Bacillus（ 属名，首字母亚斜写）。亚属分类单元的命名和属名相同。其中的阴阳或者中性指的是原本的拉丁词的性质。
（2）种名
细菌的命名也和其他的生物一样用双名法命名，即种的学名=属名+种名。第一个词为属名，首字母要大写；第二个词为种名加词，常用形容词（要与属名性别一致），也可以用人名、地名、病名、或者其他名词（名词用主格或者所有格形式），种名加词首字母不大写。
例如Pseudomonas aeruginosa（铜绿假单胞菌）其中Pseudomonas是属名（假单胞菌属）（阴性），aeruginosa是种名加词，是拉丁形容词（阴性），原意为“铜绿色的”。
还有亚种名和属级以上的分类单元的命名我就不写了，我打字很慢。
PS：如果需要了解的话可以看高等教育出版社出版的（主编为沈萍、陈向东等）《微生物生物学》教材。希望对你有帮助。
微生物的学名采用什么原则命名
一、通用分类单元
七级分类单元：界(kingdom)、门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)；必要时可在两级之间添加辅助单元，如亚门。这七级分类单元的第一个字母必须大写，而且整个名称用正体字表示。
& 例：子囊菌纲 Ascomycetes
种：一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。
新种：sp. Nov. 或 nov. sp. 是species novel 的缩写，附在学名后。
二、学名
俗名：普通的、通俗的、地区性的名字。
& 例：用“结核杆菌”表示“结核分枝杆菌”。
学名：一个菌种的科学名称，是按照《国际细菌命名法则》命名的，国际学术界公认并通用的正式名字。
学名的命名：采用“双名制”的国际植物命名法则。
? “双名制”是瑞典植物学家林奈（Linneaus）于1953年介绍的植物命名原则，该方法已广泛用于植物、动物、微生物的命名。“双名制”是用两个拉丁文或拉丁化的其他文字组成的一个学名。
三、学名的命名方法
学名由属名和种名组成，书写时：属名+种名；翻译时，种名在前，属名在后；印刷时，学名用斜体字；书写时，在学名下加一横线表示斜体字母。
& 例：Aspergillus niger 或 Aspergillus niger
属名（曲霉） 种名（黑）
前后有两个或数个学名排在一起时，在属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个大写字母加一句号的形式。
& 例1：Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成B.
& 例2：若可能产生混淆，也e69da5e6ba9062616964757a686964616f31333262383633可写成二至三个字母，如：Bac.
属名：表示微生物的主要形态特征、生理特征或以研究者的人名表示。单数，字首大写。
& 例1：根霉属、毛霉属 —— 形态特征
& 例2：丙酸杆菌属、乳酸杆菌属 —— 生理特征+形态特征
& 例3：沙门氏杆菌属 —— 研究者的人名 + 形态特征
种名：说明微生物的颜色、形状、用途，有时用人名、地名、微生物寄生的宿主名称和致病的性质来表示。字母小写。
& 例1：黑曲霉 —— 颜色
& 例2：巴斯德酵母 —— 人名
& 例3：北京棒杆菌 —— 地名
& 例4：猪霍乱沙门氏菌 —— 寄生的宿主名称和致病性质
& 例5：种名未确定：属名加 sp.（单数）或 spp.（复数）表示。如：Bacillus sp.表示一种芽孢杆菌；Bacillus spp. 表示若干芽孢杆菌
亚种、变种的命名
? 亚种：subspecies，简称“subsp.”
? 变种：variety，简称“var.”
? 命名：三名法
属名 + 种名 + （subsp.或var.）+ 亚种（或变种）
可省略
& 例1：Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus 酿酒酵母椭圆变种
& 例2：Bacteroides fragilis subsp. Ovatus 脆弱拟杆菌卵形亚种
新种的命名
? 新种：属名 + 种名 + sp.nov.
& 例：Corymebacterium pekinense sp. Nov. AS 1.229
北京棒杆菌AS1.229新种 菌株
? 菌株（在病毒中称毒株）：表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒粒子）繁殖而成的纯种群体及其一切后代。一种微生物的每一不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株的名称放在学名的后面，可用字母、符号、编号、研究机构或菌种保藏机构的缩写来表示。
定名人、定名年份的表示
? 属名 + 种名 + （首次定名人）+ 现名定名人 + 定名年份
& 例1：Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 大肠杆菌
& 例2：Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872 枯草芽孢杆菌
参考：blog.163/fansir2008@126/blog/static/768053942010421102920226/