用交通费报销加班费合理吗？
首先用交通费报销加班费对公司来说是不合法的，但是形式上，公司是没有什么违规行为的，形式上违规的是你，所以，如果以后公司要以此为理由解雇你，你是没有办法的，甚至有诈骗罪的嫌疑。
出车记录是否可以做为加班依据
可以做加班的参考，但就像你提到的反驳理由，除非能直接证明是加班的否则也许会被驳倒！
报销单能否作为证据提交?
可以，只要是能证明存在劳动关系的j就行。
不过公司可能会说没有报销凭证，不拿出来，最简单的是找个人给你证明你在那个公司干过就可以了，工资条等很多东西都可以做证明你们存在劳动关系。
因加班产生的车费和餐费能否报销的法律依据
不合法，严重违犯劳动法的规定，可以到劳动局投诉！